日前，深圳市药监部门对外披露，近几年来，受政策环境及市场恶性竞争等因素影响，深圳市连锁药店占药店总量比例由2003年的85%，降至2009年60%，2011年进一步下降至51%。有业内人士对记者透露，深圳的情况比较特殊，其他省市连锁药店的经营情况相对较好，但整体来说，由于得不到有效的政策扶持与近年来成本上涨过快等因素影响，全国连锁药店的经营情况均不太理想。

      某医药行业资深研究人士则认为，现在中国的连锁药店集团，每个的规模都太小，难以形成规模效应，从而难以进行有效的大规模扩展因而较难形成规模竞争优势，处于扩张期的药店由于管理经营能力较差，因而也较难盈利。以美国为例，美国最大的连锁药店walgreen在2011年门店数量达到8210家，总销售722亿美元(其中处方药的销售收入占总收入的65%)，净利润27亿美元。从这个数字也可以看出，连锁药店行业的利润率并不高，必须达到比较大的规模，才有可能获得可观的盈利。而就我国的企业来看，门店数目达到1000家的都为数不多，但是从药店总量却严重超过人们的需求。依据美国的经验，大概每5000-6000人一家药店会比较合理，以我国目前的城市人口占总人口数50%计算，药店数目在10万家左右比较合理，但目前的实际数量远远超过这个数目，这就导致大家都陷入了“红海”之中，恶性竞争下，谁也占不到便宜。

      在政策上，虽然国家“十二五”规划里面明确，到“十二五”末实现连锁占三分之二的比例，然而落实到实际，连锁药店却未拿到什么真正的利好。以比较重要的基本药物的销售为例，国家的医改政策对社区医院实行零差价政策，同时进行补贴，这就使得社区医院对基本药物平进平出，药店根本无法与之竞争。在税收等方面也没有对连锁药店有实际上的优惠,这使得经营上压力很大,目前这种惨淡经营的现状，并不符合国家鼓励连锁药店做大做强的目标。